Nguyên nhân do các cơ quan chức năng chưa rà soát, nghiệm thu diện tích rừng, xác định chủ rừng để Quỹ Bảo vệ và Phát triển rừng có căn cứ chi trả. Bên cạnh đó, những diện tích rừng thuộc lưu vực sông Mã có đơn giá quá thấp, dao động từ 5 - 6 nghìn đồng/ha/năm, nên cơ quan chức năng chưa chú trọng đến việc chi trả tiền DVMTR cho các chủ rừng.