Theo Nghị định 139 thì cá nhân, nhóm cá nhân, hộ gia đình hoạt động sản xuất kinh doanh có doanh thu hàng năm từ 100 triệu đồng trở xuống là 1 trong 7 trường hợp được miễn nộp lệ phí môn bài. Tại Điều 3 của Thông tư 302 cũng nêu rõ: Mức doanh thu từ 100 triệu đồng/năm trở xuống để xác định cá nhân, nhóm cá nhân, hộ gia đình được miễn lệ phí môn bài là tổng doanh thu tính thuế thu nhập cá nhân theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập cá nhân. Đối với trường hợp được miễn lệ phí môn bài là cá nhân, nhóm cá nhân, hộ gia đình hoạt động sản xuất, kinh doanh không thường xuyên, không có địa điểm cố định theo hướng dẫn của Bộ Tài chính, Thông tư 302 cũng nêu rõ: kinh doanh không thường xuyên, không có địa điểm kinh doanh cố định thực hiện theo hướng dẫn tại Điểm a, Khoản 1, Điều 3 Thông tư số 92/2015/TT - BTC ngày 15/6/2015 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập cá nhân đối với cá nhân cư trú có hoạt động kinh doanh; hướng dẫn thực hiện một số nội dung sửa đổi, bổ sung về thuế thu nhập cá nhân quy định tại Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của các Luật về thuế số 71/2014/QH13 và Nghị định số 12/2015/NĐ - CP ngày 12/2/2015 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của các nghị định về thuế. Cá nhân, nhóm cá nhân, hộ gia đình không có địa điểm kinh doanh cố định bao gồm: trường hợp cá nhân là xã viên hợp tác xã và hợp tác tác xã đã nộp lệ phí môn bài theo quy định đối với hợp tác xã; cá nhân trực tiếp ký hợp đồng làm đại lý xổ số, đại lý bảo hiểm, đại lý bán đúng giá thực hiện khấu trừ thuế tại nguồn; cá nhân hợp tác kinh doanh với tổ chức theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập cá nhân.
Thời hạn nộp lệ phí môn bài chậm nhất là ngày 30/1 hàng năm, trường hợp mới ra kinh doanh hoặc mới thành lập thì thời hạn nộp lệ phí môn bài chậm nhất là ngày cuối cùng của thời hạn nộp hồ sơ khai lệ phí môn bài.
Nhằm giảm thủ tục cho người nộp lệ phí môn bài, Nghị định 139 còn quy định rõ: tổ chức, cá nhân kinh doanh đang hoạt động kinh doanh đã khai và nộp lệ phí môn bài trước ngày 1/1/2017 thì không phải nộp hồ sơ khai lệ phí môn bài cho các năm tiếp theo nếu không có sự thay đổi các yếu tố làm căn cứ xác định lại mức thu lệ phí môn bài phải nộp.